El Pincha debutará el fin de semana del 7 de febrero ante Lanús en condición de local, mientras que en las fechas 7 y 14 tendrá sus jornadas interzonales ante Gimnasia. El primer clásico lo disputará como local el fin de semana del 13 de marzo, mientras que en el segundo será visitante el fin de semana del domingo 24 de abril.
El campeonato concluirá el 29 de mayo con la gran final, y en el mismo se definirán cuatro de las cinco plazas que Argentina tiene para la Copa Libertadores 2017. Las mismas serán entregadas a los dos primeros de cada zona, mientras que el cupo restante quedará para el campeón de la Copa Argentina.
A continuación, el fixture completo de Estudiantes en el Torneo Transición 2016:
- Fecha 1: Lanús (L)
- Fecha 2: Atlético de Rafaela (V)
- Fecha 3: Tigre (L)
- Fecha 4: Aldosivi (V)
- Fecha 5: Argentinos (L)
- Fecha 6: Huracán (V)
- Fecha 7: Gimnasia (L)
- Fecha 8: Defensa y Justicia (L)
- Fecha 9: Temperley (V)
- Fecha 10: Atlético Tucumán (L)
- Fecha 11: San Martín (V)
- Fecha 12: Gimnasia (V)
- Fecha 13: Newell’s (L)
- Fecha 14: Racing (V)
- Fecha 15: Boca (L)
- Fecha 16: Unión (V)
